A Metagenômica é uma técnica que possibilita estudar o material genético (genoma) de microrganismos recuperados diretamente de amostras de um dado ambiente com o objetivo de compreender a composição, estrutura, dinâmica ou função das comunidades microbianas sem a necessidade de fazer a cultura das amostras. Para isso, o DNA é sequenciado a partir da técnica do Sequenciamento de Nova Geração (NGS – Next Generation Sequencing) e análises de Bioinformática são utilizadas para a identificação dos microrganismos de interesse.